MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus islandicus L.D.8.5 plasmid pLD8501

Total Repeats: 448

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013770	CTTAT	2	10	2726	2735	20 %	60 %	0 %	20 %	284807104
2	NC_013770	AGA	2	6	2748	2753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807104
3	NC_013770	GGTT	2	8	2761	2768	0 %	50 %	50 %	0 %	284807104
4	NC_013770	TTTC	2	8	2870	2877	0 %	75 %	0 %	25 %	284807104
5	NC_013770	TTC	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807104
6	NC_013770	CTT	2	6	3003	3008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807104
7	NC_013770	AGA	2	6	3020	3025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807104
8	NC_013770	AAGAG	2	10	3026	3035	60 %	0 %	40 %	0 %	284807104
9	NC_013770	AAGA	2	8	3049	3056	75 %	0 %	25 %	0 %	284807104
10	NC_013770	ATG	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807104
11	NC_013770	TGAAA	2	10	3165	3174	60 %	20 %	20 %	0 %	284807104
12	NC_013770	TGC	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284807104
13	NC_013770	AGG	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284807104
14	NC_013770	A	7	7	3280	3286	100 %	0 %	0 %	0 %	284807104
15	NC_013770	CTTTT	2	10	3322	3331	0 %	80 %	0 %	20 %	284807105
16	NC_013770	AT	3	6	3368	3373	50 %	50 %	0 %	0 %	284807105
17	NC_013770	CTT	2	6	3401	3406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807105
18	NC_013770	TA	3	6	3446	3451	50 %	50 %	0 %	0 %	284807105
19	NC_013770	TTG	2	6	3606	3611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807106
20	NC_013770	ATC	2	6	3768	3773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807106
21	NC_013770	TAA	2	6	3810	3815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807106
22	NC_013770	TA	3	6	3891	3896	50 %	50 %	0 %	0 %	284807106
23	NC_013770	TAT	2	6	3938	3943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807106
24	NC_013770	TC	3	6	4035	4040	0 %	50 %	0 %	50 %	284807106
25	NC_013770	TTGAG	2	10	4076	4085	20 %	40 %	40 %	0 %	284807106
26	NC_013770	TCT	2	6	4093	4098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807106
27	NC_013770	GAA	2	6	4107	4112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807106
28	NC_013770	TCC	2	6	4137	4142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807106
29	NC_013770	TTAG	2	8	4168	4175	25 %	50 %	25 %	0 %	284807106
30	NC_013770	TTCT	2	8	4201	4208	0 %	75 %	0 %	25 %	284807106
31	NC_013770	TCT	2	6	4234	4239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807106
32	NC_013770	TTATA	2	10	4298	4307	40 %	60 %	0 %	0 %	284807106
33	NC_013770	CGT	2	6	4310	4315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284807106
34	NC_013770	ATT	2	6	4318	4323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807106
35	NC_013770	TAA	2	6	4382	4387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807106
36	NC_013770	TTCA	2	8	4407	4414	25 %	50 %	0 %	25 %	284807106
37	NC_013770	TA	3	6	4424	4429	50 %	50 %	0 %	0 %	284807106
38	NC_013770	A	6	6	4459	4464	100 %	0 %	0 %	0 %	284807106
39	NC_013770	TAA	2	6	4511	4516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807107
40	NC_013770	TAA	2	6	4567	4572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807107
41	NC_013770	AT	3	6	4590	4595	50 %	50 %	0 %	0 %	284807107
42	NC_013770	CTT	2	6	4605	4610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807107
43	NC_013770	T	6	6	4609	4614	0 %	100 %	0 %	0 %	284807107
44	NC_013770	TA	4	8	4618	4625	50 %	50 %	0 %	0 %	284807107
45	NC_013770	CTA	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807107
46	NC_013770	AT	3	6	4674	4679	50 %	50 %	0 %	0 %	284807107
47	NC_013770	TGT	2	6	4750	4755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807107
48	NC_013770	AAT	2	6	4776	4781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807107
49	NC_013770	TTA	2	6	4788	4793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807107
50	NC_013770	TAT	2	6	4914	4919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807107
51	NC_013770	TA	3	6	4935	4940	50 %	50 %	0 %	0 %	284807107
52	NC_013770	TCC	2	6	4949	4954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807107
53	NC_013770	T	6	6	4959	4964	0 %	100 %	0 %	0 %	284807107
54	NC_013770	AT	3	6	5035	5040	50 %	50 %	0 %	0 %	284807107
55	NC_013770	AAT	2	6	5073	5078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807107
56	NC_013770	TCT	2	6	5085	5090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807107
57	NC_013770	TTC	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807107
58	NC_013770	GA	3	6	5158	5163	50 %	0 %	50 %	0 %	284807107
59	NC_013770	AGA	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807108
60	NC_013770	A	6	6	5543	5548	100 %	0 %	0 %	0 %	284807108
61	NC_013770	ATA	2	6	5587	5592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807108
62	NC_013770	GAA	2	6	5599	5604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807108
63	NC_013770	CAT	2	6	5613	5618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807108
64	NC_013770	AAG	2	6	5701	5706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807108
65	NC_013770	ATTT	2	8	5776	5783	25 %	75 %	0 %	0 %	284807108
66	NC_013770	A	6	6	5788	5793	100 %	0 %	0 %	0 %	284807108
67	NC_013770	CTAATG	2	12	5911	5922	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284807109
68	NC_013770	CAT	2	6	6002	6007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807109
69	NC_013770	CTA	2	6	6091	6096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807109
70	NC_013770	GTA	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807109
71	NC_013770	AAC	2	6	6141	6146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284807109
72	NC_013770	AAT	2	6	6172	6177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807109
73	NC_013770	AAG	2	6	6192	6197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807109
74	NC_013770	AGC	2	6	6203	6208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284807109
75	NC_013770	C	6	6	6212	6217	0 %	0 %	0 %	100 %	284807109
76	NC_013770	AGC	2	6	6317	6322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284807109
77	NC_013770	AAT	2	6	6401	6406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807109
78	NC_013770	ACA	2	6	6457	6462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284807109
79	NC_013770	AAT	2	6	6498	6503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807109
80	NC_013770	AAG	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807109
81	NC_013770	CTA	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807109
82	NC_013770	ACT	2	6	6837	6842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807109
83	NC_013770	AAT	2	6	6877	6882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807109
84	NC_013770	TCTG	2	8	6885	6892	0 %	50 %	25 %	25 %	284807109
85	NC_013770	AGGT	2	8	6907	6914	25 %	25 %	50 %	0 %	284807109
86	NC_013770	TCC	2	6	6959	6964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807109
87	NC_013770	GCT	2	6	6984	6989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284807109
88	NC_013770	CCT	2	6	7134	7139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807109
89	NC_013770	CCA	3	9	7140	7148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284807109
90	NC_013770	TAT	2	6	7163	7168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807109
91	NC_013770	ATT	2	6	7206	7211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807109
92	NC_013770	TAC	2	6	9166	9171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807110
93	NC_013770	CTAA	2	8	9236	9243	50 %	25 %	0 %	25 %	284807110
94	NC_013770	TCC	2	6	9288	9293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807110
95	NC_013770	TGA	2	6	9322	9327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807110
96	NC_013770	TCC	2	6	9338	9343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807110
97	NC_013770	GTC	2	6	9349	9354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284807110
98	NC_013770	TCA	2	6	9390	9395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807110
99	NC_013770	AAC	2	6	9443	9448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284807110
100	NC_013770	CCT	2	6	9537	9542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807110
101	NC_013770	GCATT	2	10	9555	9564	20 %	40 %	20 %	20 %	284807110
102	NC_013770	TCT	2	6	9584	9589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807110
103	NC_013770	ATT	2	6	9593	9598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807110
104	NC_013770	TATC	2	8	9654	9661	25 %	50 %	0 %	25 %	284807110
105	NC_013770	CTT	2	6	9700	9705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807110
106	NC_013770	TCG	2	6	9716	9721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284807110
107	NC_013770	C	6	6	9804	9809	0 %	0 %	0 %	100 %	284807110
108	NC_013770	TTA	2	6	9864	9869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807110
109	NC_013770	TGT	2	6	9908	9913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807110
110	NC_013770	TCT	2	6	9925	9930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807110
111	NC_013770	CTC	2	6	9931	9936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807110
112	NC_013770	CAC	2	6	10092	10097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284807111
113	NC_013770	TCC	2	6	10105	10110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807111
114	NC_013770	AGA	2	6	10148	10153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807111
115	NC_013770	TCC	2	6	10156	10161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807111
116	NC_013770	TGT	2	6	10165	10170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807111
117	NC_013770	TAG	2	6	10188	10193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807111
118	NC_013770	TCC	2	6	10250	10255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807111
119	NC_013770	TCT	2	6	10295	10300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807111
120	NC_013770	GTT	2	6	10310	10315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807111
121	NC_013770	TCC	2	6	10342	10347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807111
122	NC_013770	TCT	2	6	10399	10404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807111
123	NC_013770	TGT	2	6	10444	10449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807111
124	NC_013770	TCC	2	6	10459	10464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807111
125	NC_013770	TCC	2	6	10471	10476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807111
126	NC_013770	CTT	2	6	10485	10490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807111
127	NC_013770	CTA	2	6	10499	10504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807111
128	NC_013770	TTC	2	6	10512	10517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807111
129	NC_013770	CCT	2	6	10553	10558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807111
130	NC_013770	CTCTTC	2	12	10566	10577	0 %	50 %	0 %	50 %	284807111
131	NC_013770	TCC	2	6	10585	10590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807111
132	NC_013770	TTA	2	6	10645	10650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807111
133	NC_013770	TCCT	2	8	10699	10706	0 %	50 %	0 %	50 %	284807111
134	NC_013770	TCTT	2	8	10721	10728	0 %	75 %	0 %	25 %	284807111
135	NC_013770	GTAA	2	8	10735	10742	50 %	25 %	25 %	0 %	284807111
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